日本沼虾不同亚型维甲酸类X受体(RXR)cDNA克隆及序列分析

摘要

采用RT-PCR和RACE末端扩增技术,从日本沼虾(Macrobrachium nipponense)卵巢组织中获得了5种不同构型的RXR基因cDNA序列.结果显示:RXR基因中MnRXRL2含有最长的开放阅读框(open reading frame,ORF),其全长1698 bp,编码337个氨基酸.对比5个不同构型的核苷酸序列,有四个不同的剪接位点,一个发生在5'端A/B区域,产生了3种不同形式的5'端序列;一个在RXR受体结构的D区即铰链区域,使T-盒区长度也有3种形式(VQEERQR/VQVGGIEEERQR/VQVGGIE);两个发生在LBD区,其中一个是在H2-H3螺旋区域,产生了2种不同形式(MnRXRL/MnRXRS),另外一个是在D区产生了中断,缺失了E/F区域(MnRXRM).将各个序列编码的氨基酸序列与其他物种相比,与甲壳类的同源性较高,表明RXR在进化中较为保守.