核桃品种及近缘树种鉴定的DNA条形码开发

摘要

为筛选适合形态学不易区分的核桃品种及近缘树种鉴定的DNA条形码,提供准确鉴定核桃品种的新途径,确保核桃产业良种化健康发展,以11个核桃品种和5个近缘种为试材,以3个叶绿体基因(rbcL、psbA-trnH、matK)和1个核DNA(ITS1)序列为候选条形码,通过对候选条形码片段的扩增、测序和序列变异分析,选择扩增效率高、品种间变异位点丰富的DNA条形码。结果表明,4条候选DNA条形码在16个供试树种(品种)中的扩增和测序成功率均为100%。rbcL序列在树种(品种)间的差异极小,psbA-trnH序列只在属间有差异。matK和ITS1序列在树种间存在差异,序列一致性分别为99.12%和99.88%,碱基位点变异数分别为18个和8个;不同树种(品种)在基于matK序列构建的系统发育树中能明显区分,验证了利用matK鉴定核桃品种及其近缘种的准确性。从而得到使用matK+ITS1条形码组合可以有效鉴别核桃品种及其近缘种。