暗纹东方鲀线粒体COIII克隆及序列分析

摘要

克隆并测定了暗纹东方鲀线粒体基因组( mtDNA)含完整的细胞色素氧化酶亚基Ⅲ(COIII)及其下游70 bp的tRNAGly序列.COIII基因编码框包含786个核苷酸,编码262个氨基酸的蛋白质.鱼类COIII的序列组成对A+T核苷酸的偏倚程度比较低.通过暗纹东方鲀与GenBank中8个目12种鱼类的COIII序列同源性比较, 显示暗纹东方鲀与这些鱼类的COIII基因具有较高的同源性.根据暗纹东方鲀与鲀目其他5种鱼的COIII基因序列所建立的进化树,与传统的分类地位相吻合.推定的tRNA的二级结构具有典型的三叶草型结构.根据COIII序列构建的分子进化树分析,认为在采用线粒体基因序列进行分子进化分析时,应综合考虑物种遗传变异的特点.