基于图正则化协同矩阵分解预测miRNA-疾病关联

摘要

本文提出了基于图正则化协同矩阵分解(GRCMF)的新方法,用于发现miRNA与疾病之间的潜在关联。首先,我们将疾病语义信息和miRNA功能信息结合起来,对数据采用预处理步骤加权K最近邻(WKNKN)。其次,利用图正则化协同矩阵分解同时识别所有疾病与miRNA的潜在关联。结果表明,与其它方法相比,我们提出的方法可以有效地推断与疾病相关的miRNA,在留一验证和五折交叉验证中,AUC值分别为0.9276和0.9265,这表明基于图正则化协同矩阵分解(GRCMF)能够较好地发现潜在的疾病相关miRNA。