利用生物信息学发现长链非编码RNA DSCAM-AS1为肺腺癌潜在治疗靶点

摘要

目的筛选肺腺癌的潜在靶点,运用生物信息学探索肺腺癌发病机制。方法癌症和肿瘤基因图谱（TCGA）收集并整理有关肺腺癌长链非编码RNA（lncRNA）的数据,利用R语言筛选癌和癌旁表达差异的lncRNA,并预测它们的靶基因,用Cytoscape软件进行基因本体（GO）分析和蛋白相互作用网络（PPI）构建。结果 1476个lncRNA在肺腺癌中差异表达,其中1230个上调,246个下调;其中表达差异最显著的是DSCAM-AS1。通过共表达网络积分分析识别出DSCAM-AS1对应的41个可能的靶基因。基因本体论富集分析发现DSCAM-AS1通过细胞信号传导、细胞新陈代谢、能量相关通路等与肺腺癌的发病有关。通过Kaplan Meier Plotter进行生存预后的分析。结论最终确定DSCAM-AS1可能是肺腺癌潜在的治疗靶点。利用生物信息学方法能有效筛选目标基因,并可为进一步实验验证提供依据。