2018-2020年上海市5岁以下住院儿童病毒性腹泻病原学特征分析

摘要

目的 对2018-2020年上海市5岁以下感染性肠胃炎住院患儿进行主要病毒病原学检测,了解目标人群中病毒的分子流行病学迁移变化特征,为病毒性腹泻的防控和疫苗研发及应用提供数据支撑.方法 采集上海市某儿科医院5岁以下腹泻住院患儿的粪便标本,并收集相关流行病学资料.采用ELISA、荧光PCR以及巢式PCR方法对轮状病毒、杯状病毒(包括诺如病毒和札如病毒)、星状病毒和肠道腺病毒进行检测和分子分型.结果 共采集粪便标本805份(男性543份,女性262份),病毒检出率为47.33％,检出率最高的病毒为杯状病毒(31.18％),其次为A组轮状病毒(17.64％);杯状病毒中诺如病毒GⅡ型的占比最高(95.62％).轮状病毒以G9P [8]为主要流行型别(占比90.85％).诺如病毒GⅡ型以GⅡ.4[P31]和GⅡ.3[P12]为主要流行株(占比分别为32.08％和19.58％);但2020年以来,新兴亚型GⅡ.4[P16]和GⅡ.2[P16]检出率明显高于2018和2019年(x2=17.337,P＜0.001;x2=11.044,P=0.001).此外本地首次从1名4月龄患儿粪便中发现1株乐儿德轮状病毒疫苗株.结论 杯状病毒检出率高于轮状病毒的趋势加剧,使杯状病毒(主要是诺如病毒)疫苗的研发和上市需求愈发迫切.研究首次揭示了住院儿童中诺如病毒GⅡ型的主要流行和新兴亚型,为多效价的诺如疫苗研发提供了参考依据.轮状病毒G9型别近年检出率升高,需要对轮状病毒型别变化保持警戒、追踪和深究.