黄灯笼辣椒肉桂酰辅酶A还原酶(CCR1)基因的克隆及序列分析

摘要

CCR是调控苯丙烷代谢木质素合成支路的关键酶,其活性对辣椒辣味具有重要影响,本研究通过RT-PCR结合RACE法成功从海南黄灯笼椒茎尖克隆到一个全长CCR1,并通过DNAMAN、DNAStar等软件与网站对该序列进行生物信息学分析,结果表明:黄灯笼辣椒CCR1 cDNA序列全长1 362 bp,含有一个840 bp的完整的ORF,编码279个氨基酸;该基因编码蛋白无跨膜结构域,无信号肽,不是分泌蛋白,亚细胞定位于细胞质,为亲水蛋白;其氨基酸序列与拟南芥、巴西橡胶、番茄、烟草相似度达79.94%,存在一个CCR基因的典型保守序列—KNWYCYGK;CCR1基因与番茄、马铃薯、烟草等茄科植物亲缘关系较近。这为后续进一步分析CCR1功能,通过调控辣椒木质素路径来提高辣椒素含量提供依据。