输入性甲型H1N1流感病毒M、NP、PB1基因进化特征

摘要

目的分析口岸输入性甲型H1N1流感病毒的M、NP和PB1基因进化特征,及时发现变异株。方法对广东口岸2009-2011年检测的甲型H1N1流感阳性病例进行M、NP和PB1基因的RT-PCR扩增和核苷酸序列测定。以2009年甲型H1N1流感代表株A/California/04/2009/H1N1的M、NP和PB1基因作为参考序列,分析输入性病例的系统进化树、核苷酸及氨基酸序列同源性和变异位点。结果 M基因系统进化树分为4个分支,2009年病毒与2010年病毒主要分布在第Ⅰ分支,2011年检出的多数病毒聚集于第Ⅳ分支。同源性结果显示M基因高度保守,仅有5个核苷酸位点发生显著变异,对应的蛋白序列仅在氨基酸V80I位点出现突变。所有病毒NP蛋白均出现V100I突变,同时零星出现K452R突变。PB1蛋白氨基酸序列在G154D、I397M和I435T等位点发生较明显突变。结论 2009-2011年输入性甲型H1N1流感病毒M、NP、PB1基因已发生一定程度的变异,对口岸和国内流感防控提供了重要的理论依据。