EV71肠道病毒VP4基因序列与重症手足口病的相关性研究

摘要

目的研究肠道病毒71型病毒分离株VP4区基因序列特征及其与重症手足口病的相关性,为儿童重症手足口病的防控工作提高理论指导。方法选取2017年4月-2020年3月本院接诊重症手足口患儿120例,采用RT-PCR分离EV71病毒株,对病毒VP4区全长基因进行扩增和序列检测,探究其与重症手足口病的相关性。结果经肠道病毒荧光RT-PCR检测发现,EV71病毒阳性检出89例,检出率为74.17%(89/120);EV71株VP4基因核普酸序列及氨基酸序列均与C4a基因型相似性最高。基因编码区核苷酸同源性高达93.6%~99.9%,氨基酸同源性高达98.7%~100.0%;通过进化树分析,EV71肠道病毒VP4基因可分C4a和C4b2个亚型。EV71 VP4片段氨基酸序列26位苏氨酸(T)变异为丙氨酸(A),偶有K52R突变。结论儿童重症手足口病EV71肠道病毒流行株均属C基因型的C4a亚型,其中VP4片段偶有K52R突变,其基因突变与HFMD患儿疾病危重密切相关。