ARN数据库:重组和可视化成脂调控网络信息

摘要

肥胖是工业化国家面临的巨大挑战。同时,许多代谢相关的疾病如糖尿病、动脉粥样硬化等也和脂肪的累积息息相关。因此,我们有必要深入理解成脂(脂肪组织形成的过程)的分子机制。然而,信息的碎片化严重阻碍着新的关键基因及通路的识别,于是我们想到要为专业的研究人员提供一个方便易用的成脂调控信息中心。在本研究中,我们通过文本挖掘技术辅以专业人员的人工检查和注释,整理收集来自PubMed数据库的1457篇与成脂分化相关的文章,搭建了一个公开的数据库平台——ARN数据库,截止到2016年2月25日,共收集到与成脂相关的3054个节点,1807条互作关系,10,675条表达记录,并通过miRGate、PAZAR和TRRUST等数据库确定了12,696条可能存在的靶向调控关系,为成脂研究领域的研究者提供了一个快速便捷的可视化信息中心。因此,这个平台将有助于研究者发现成脂调控中的重要基因和通路。