基于结构比对的蛋白结合位点预测方法

摘要

蛋白质通过结合位点与其他分子产生相互作用,所以对蛋白结合位点的预测具有重要的意义.现有许多不同的预测方法,但是这些方法存在命中率低或计算量大的问题,本文引入了一种基于结构比对的蛋白质位点预测方法,同时在结构比对过程中引入同源索引,找出相应的同源模版,并与之进行结构比对,然后将结构相似的模版中的配体映射到目标蛋白质中,采用聚类方法对位点进行分析.结果表明,与其他预测方法相比,本文的方法降低了计算量,并提高了预测精度.