PCA技术在二硫键连接模式预测中的应用研究

摘要

关于二硫键是由蛋白质的两个半胱氨酸之间配对形成的一种共价键,可以存在于同一条蛋白质多肽键内,也可以存在于不同的多肽键之间.二硫键的形成是蛋白质折叠过程中的重要步骤,同时影响蛋白质折叠的速率和途径.因此利用计算机方法预测二硫键连接模式有非常重要的意义.采用一种新的方法预测二硫键连接模式.结合序列多重特征向量和通过PSIPRED得出的二级结构预测信息.由于原方法会产生高维数据,使用PCA进行降维,在降维后的低维数据上采用支持向量回归技术(SVR)来预测二硫键连接模式.结果显示,上述方法提高了预测精度.