厚壁菌门下两类细菌的DNA全序列可视化研究

摘要

为了探索生物层次间的关系,从复杂细菌群落到各类种属细菌,全序列DNA测序蓬勃发展,对各种生物基因序列科学计算数据可视化的需求日益迫切.DNA序列双螺旋结构与空间复杂结构的互补对称性对于探索大量的长DNA序列具有重要意义.文中从"序列决定结构,结构决定功能"这一核心思想出发,基于一种基于变值体系的测量模型和方法,利用信息技术和统计学结合的方法对芽孢杆菌(Bacillus)和分枝杆菌(Mycobacterium)两类细菌的DNA全序列进行分析比较,展现了它们的DNA全序列二维特征分布,以可视化的形式显示这两类细菌的异同.与传统的细菌可视化方法相比,该方法具有时间复杂度低、稳定性好、直观性强、易于理解的特点.在不同的测量参考选择下提供了一系列分布图示.