基于SAA的苏云金杆菌代谢网络功能模块

丁德武; 陆克中; 须文波; 吴璞; 黄海生

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基于SAA的苏云金杆菌代谢网络功能模块

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摘要

比较几种常用的社团结构分析方法,讨论它们在代谢网络分析中的不足之处.模拟退火算法在代谢网络模块分析中具有一定优势,选用该算法分析苏云金杆菌代谢网络巨强连通体中的功能模块,并将所得的结果与KEGG数据库中的途径信息进行对比研究,发现大部分的模块都对应于1～2个KEGG途径.进一步的研究表明这些模块均具备重要的生物学功能意义.

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来源
《计算机工程》 |2010年第13期|162-163166|共3页
作者
丁德武; 陆克中; 须文波; 吴璞; 黄海生;
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作者单位

池州学院数学与计算机科学系;

池州247000;

江南大学信息工程学院;

无锡214036;

池州学院数学与计算机科学系;

池州247000;

江南大学信息工程学院;

无锡214036;

池州学院数学与计算机科学系;

池州247000;

池州学院数学与计算机科学系;

池州247000;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类信息处理（信息加工）;
关键词
社团结构; 代谢网络; 模块性; 模拟退火算法;

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