利用双树复小波特征进行蛋白质二级结构预测

摘要

识别蛋白质二级结构对于蛋白质的特征和性质研究具有很重要的作用。用Cα原子三维空间坐标把蛋白质序列映射为距离矩阵,针对距离矩阵中隐含的纹理信息,用双树复小波变换对矩阵进行4级分解,提取不同方向的子带能量和标准偏差,得到48维特征向量来表示蛋白质的二级结构特征,再将提取的特征输入KNN和SVM分类器分类,通过实验验证,双树复小波特征能改善传统特征提取方法的纹理粒度和方向局限问题,提高蛋白质二级结构的预测准确率。