序列拼装程序的并行化研究与实现

蔡立志; 童维勤; 廖文昭

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序列拼装程序的并行化研究与实现

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基因序列拼装是分子生物研究的重要环节之一.随着DNA序列的快速增长,如何提高基因序列拼装的速度,成为当前基因组研究的重要问题.为充分利用SMP以及集群的资源,在找出Phrap程序的瓶颈后,分别在SUN Enterprise3500及集群上将串行的Phra程序进行了并行化.论文论述实现并行拼接程序的机理和性能.

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来源
《计算机工程与应用》 |2003年第14期|105-107|共3页
作者
蔡立志; 童维勤; 廖文昭;
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作者单位

上海大学计算机学院;

上海;

200072;

上海大学计算机学院;

上海;

200072;

上海大学计算机学院;

上海;

200072;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类程序设计、软件工程;
关键词
并行化; 序列拼装; 消息传递;

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