蛋白质交互网络模块化的数据分析

摘要

生物网络的模块化是生物系统鲁棒性的一个基本前提.首先根据已有的算法分析改进了经典的谱方法,提出了一个提高模块化方法分辨率的策略.采用不同采源的蛋白质网络来计算地分析网络的模块化属性,发现尽管这些蛋白质网络都展现了较高的模块化程度,但模块化的程度受到数据来源的影响.同时还发现基因在全基因组复制以后,会倾向于在同一个模块中出现,这说明复制基因功能不会产生特别大的差异,使得当删除一个复制基因时,模块内的另一个复制基因会有功能的补偿.