一种用于多重生物序列比对的协同进化算法

张树波

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一种用于多重生物序列比对的协同进化算法

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序列比对是生物序列分析的一项基础性工作,多重生物序列比对可以帮助预测未知序列的结构和功能.在传统遗传算法的基础上,提出了一种用于多重生物序列比对的协同进化算法,通过引进协同进化机制,使得保守区域和位点以较高的概率传给子代,而非保守区域和位点以较低的概率传给子代.在BAliBASE3.0数据库上,该方法获得比常用的比对算法ClustralX更高的适应度,比传统的遗传算法具有更好的收敛性.

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来源
《计算机应用与软件》 |2010年第8期|37-40|共4页
作者
张树波;
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作者单位

中山大学数学与计算科学学院;

广东;

广州;

510275;

广东省信息安全重点实验室;

广东;

广州;

510275;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类
关键词
多重序列比对; 协同进化算法; 选择算子; 交叉算子; 变异算子; 保守区域;

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