基于网络药理学和生物信息学研究益气解毒方治疗鼻咽癌的分子机制

摘要

目的 基于网络药理学和生物信息学研究益气解毒方治疗鼻咽癌的分子机制。方法 TCMSP数据库检索益气解毒方的化学活性成分和作用靶点,GEO数据库获得GPL6480数据集及GSE53819表达谱,R软件筛选鼻咽癌癌组织和非癌组织中异常表达的差异基因,Cytoscape软件对靶基因进行分析并构建“活性成分-靶点”网络图,STRING数据库构建可视化PPI网络,对关键作用靶点进行GO和KEGG富集分析,采用MTT法验证益气解毒方对鼻咽癌CNE2细胞活性的影响,Western blot法验证药物对靶蛋白表达的影响。结果 益气解毒方含有131个化合物,2 424种药物活性成分,预测潜在作用靶点239个;差异表达基因2 078个,韦恩图得到50个共同靶点,出现频次较高的为VEGFA、JUN、IL1B、CCND1、ICAM1等;GO、KEGG分析结果显示,关键靶点主要涉及细胞因子活性、受体配体活性等生物过程,主要富集在IL-17、TNF、NF-κB等信号通路;细胞验证实验表明益气解毒方水提物对CNE2细胞活性具有抑制作用(P<0.05,P<0.01),且呈剂量和时间依赖性;还能降低细胞中NF-κB、CCND1、P21蛋白表达(P<0.05,P<0.01)。结论 益气解毒方可能通过TNF和NF-κB等信号通路来治疗鼻咽癌。