2008-2009年江苏省肠道病毒71型分子流行病学研究

摘要

目的 探讨2008-2009年江苏省肠道病毒71型(EV71)分离株的病毒基因特征.方法 选取18份EV71分离株,用一对特异引物进行VP1全基因核苷酸序列扩增,在ABI3130型自动测序仪上测序,序列结果 用DNA Star和MEGA4软件进行分析,并与各型参考株进行比较.结果 18株病毒与安徽省阜阳市和山东省临沂市分离的C4a基因型参考株最为相近,核苷酸同源性在96.3%～99.6%之间,氨基酸同源性在99.0%～99.7%之间;而与A、B 基因型参考株比较差异较大,核苷酸同源性只在81.8%～84.4%之间,氨基酸同源性在94.3%～97.0%之间;说明本文的18株病毒均属于EV71型C4a基因型.结论 2008-2009年江苏省分离的18株EV71可能与安徽省和山东省分离的EV71有相同的起源,均属于C4a亚型;目前C4a亚型病毒在中国大陆可能有较广泛的分布和传播.