10株广西猪圆环病毒3型(PCV3)全基因组序列的遗传变异分析

摘要

为了解广西猪群猪圆环病毒3型(PCV3)的遗传变异情况,以PCV3阳性DNA为模板,利用PCR的方法分2段扩增PCV3全基因序列并进行拼接,获得10株PCV3全基因组序列,全长均为2 000 bp.10株广西PCV3全基因组序列之间的核苷酸同源性为98.6％～ 99.8％.与国内其他毒株的同源性为97.9％ ～ 99.8％;与国外其他毒株的同源性为98.8％～99.7％.10株广西PCV3 Cap基因的大小均为645 bp,编码214 aa.PCV3 Cap基因比较保守,10株广西PCV3 Cap基因与参考株相比,仅存在散在的突变位点.基于PCV3全基因和Cap基因构建的遗传进化树显示,两者结果基本相同,10株广西PCV3处于3a和3b两个亚群.本试验表明,广西地区猪群中流行的PCV3至少存在2个亚群,不同亚群PCV3毒株的致病性差异还有待进一步的研究.