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传染性法氏囊病病毒BC6/85株全基因组克隆及其序列分析

     

摘要

以传染性法氏囊病病毒(IBDV) BC6/85株基因组RNA为模板,采用RT-PCR方法扩增并克隆了IBDV BC6/85株基因组全长cDNA.序列测定结果表明:A节段全长共3260个核苷酸,与IM株的同源性最高为97.4%,与其他血清Ⅰ型毒株的核苷酸同源性介于91.2% ~97.1%;B节段有2827个核苷酸,与IM株同源性最高为98.6%,与其他毒株的核苷酸同源性为88.7%~98.6%.通过对编码的氨基酸序列进行分析,发现BC6/85株有21个特有氨基酸,其中15个位于多聚蛋白VP2-4-3.系统进化树分析表明,BC6/85株与经典毒株、弱毒株和变异株的关系较近,而与超强毒株相对较远.

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