IS6110-限制性片段长度多态性DNA分型在结核分子流行病学研究中的应用

摘要

目的建立宁夏、北京和上海等地结核分支杆菌临床分离株IS6110-RFLP DNA指纹图谱,观察其流行病学特征.方法提取结核分支杆菌基因组DNA,经限制性内切酶 PvuⅡ切割、琼脂糖凝胶电泳和 Southern转印后,用荧光标记的IS6110 DNA序列中245 bp探针杂交,以核酸化学发光试剂盒探测荧光信号,比较各菌株指纹的IS6110拷贝数和带型,分析不同地理区域流行菌株的特点.结果 103例结核患者的临床分离株,经245 bp探针杂交后的指纹图谱显示大部分菌株含8～21个IS6110拷贝.在宁夏和北京地区流行的结核分支杆菌带型具有共同特点,并有成簇分布的现象;在上海分离株中发现1 株零拷贝株和1株单拷贝株.结论 IS6110-RFLP DNA分型方法可用于我国流行的结核分支杆菌分子流行病学研究;宁夏分离株与北京分离株在基因上亲缘关系较相近.