2016年～2017年山东地区商品肉鸡H9N2亚型禽流感病毒HA基因的分子特征和遗传进化分析

摘要

为了解山东地区商品肉鸡H9N2亚型禽流感病毒(AIV)分离株的遗传变异情况,本研究对13株从不同肉鸡场分离的H9N2 AIV的HA基因进行PCR扩增、克隆和测序,并对获得的HA基因序列进行同源性和遗传进化分析.结果显示:13个分离株的HA裂解位点均为RSSR ↓ GLF,符合低致病性AIV的分子特征;8株分离株有8处糖基化位点,其余5株存在个别位点缺失情况;受体结合位点除198位有变异外,其它位点均保守;234位氨基酸均为L,因此具有与哺乳动物唾液酸α,2-6受体结合的特征.所有分离株HA基因核苷酸同源性为94.1％～99.8％,氨基酸同源性为94.3 ％～100％.HA基因进化树显示,所有分离株均属于欧亚分支中的A/Chicken/Beijing/1/1994 (A/Duck/HongKong/Y280/97)亚群,也同属于近几年在中国鸡群中流行的以A/chicken/Zhejiang/HJ/2007为代表的G57分支.以上研究为H9N2亚型AIV的防控和疫苗研制提供了科学参考.