星形胶质细胞瘤甲基化和非编码RNA表观基因组学研究

摘要

目的星形胶质细胞瘤是一种常见的胶质瘤,患者的生存期及预后情况十分堪忧。本研究旨在发现影响星形胶质细胞瘤发生发展的重要生物标志物及通路,并根据星形胶质细胞瘤的分子遗传学特征初步建立分子分型的方法,以提高诊疗的有效性,改善患者的生存状况。方法本次研究通过Illumina 450K Infinium Methylation Bead Chip、Agilent miR NA芯片及Agilent lncR NA+mR NA表达谱芯片对33例星形胶质细胞瘤肿瘤组织及9例对照脑组织的甲基化、miR NA、m RNA及lnc RNA进行全基因组检测。通过生物信息学方法发现肿瘤组与对照组间的差异化位点及通路,并结合患者病例信息对星形胶质细胞瘤样本进行分子分型。结果通过肿瘤组与对照组的差异化分析发现,钙信号通路相关的基因、甲基化、mi RNA及lnc RNA的表达均对星形胶质细胞瘤的发生发展产生了显著的影响,并与患者的总体生存期相关。利用多平台数据整合分析方法,可将IDH基因野生型星形胶质细胞瘤分为表达特征不同的两个亚型,并且两亚型间钙信号通路的表达水平具有显著性差异。结论本课题研究结果表明,钙信号通路在星形胶质细胞瘤发生发展的过程中起到了重要的作用,可作为IDH基因野生型星形胶质细胞瘤亚型的标志物,并对患者的预后水平产生了一定的影响,具有成为新治疗靶标的潜力。