补骨脂素诱导BMSCs成骨分化中的LncRNA表达谱分析

摘要

目的 观察补骨脂诱导骨髓间充质干细胞(BMSCs)成骨分化过程中长链非编码RNA(lncRNA)的表达谱及相关靶基因和信号通路.方法 取P2代BMSCs分为三组:空白组(含10％FBS的L-DMEM)、成骨诱导组(含10％FBS及成骨诱导剂的L-DMEM)、补骨脂素组(含10％FBS的L-DMEM及10μmol/L补骨脂素),同一环境不同诱导条件干预21 d;利用Agilent lncRNA芯片筛选出成骨诱导分化过程中表达差异2倍以上的lncRNA,并通过荧光定量PCR对芯片结果进行验证.选取筛选结果中表达差异较大的lncRNA进行GO和KEGG分析.结果 成骨诱导分化21 d后持续表达超过2倍的lncRNA共有446个差异表达的lncRNAs.在BMSCs成骨分化过程中,共筛选出5个lncRNA显著上调,4个lncRNA显著下调.其中XR009483上调最显著,而XR007366下调最显著,经PCR验证与芯片结果相符.经GO分析富集度较高的为骨及软骨发育、干细胞分化等生物进程,以及胶原合成、骨化和钙化等生物功能.KEGG分析主要富集于15个生物学通路,其中富集评分较高的是TGF-beta、Wnt、NF-kappa B及Calcium等生物学通路.结论 补骨脂素诱导BMSCs成骨分化过程中lncRNA表达谱发生显著变化,提示差异表达的lncRNA可能与BMSCs成骨分化密切相关,为研究补骨脂素促BMSCs成骨分化机制奠定了一定基础.