贵州省狂犬病病毒流行毒株与疫苗毒株糖蛋白基因差异研究

摘要

目的分析贵州省狂犬病病毒流行毒株与疫苗毒株的糖蛋白基因（G基因）差异,为狂犬病疫苗研制及有效防控措施的制定提供科学依据。方法以RT-PCR扩增贵州省近几年人和犬狂犬病病毒阳性脑组织标本G基因序列,对扩增产物进行序列测定后采用生物信息学软件对序列与疫苗株G基因序列进行比较分析。结果贵州省狂犬病病毒阳性标本经RT-PCR扩增、测序与拼接后得到8株狂犬病病毒G基因全长序列,与我国常用狂犬病疫苗毒株在核苷酸和推导的氨基酸水平上的同源性分别为82.0%～94.1%和87.6%～97.5%,与人用疫苗株中的CTN株G基因核苷酸和氨基酸序列同源性最高（分别为87.0%～94.1%和93.7.%～97.5%）,而在兽用疫苗株中与Flury株的核苷酸和氨基酸同源性最高（分别为83.9%～84.6%和91.1%～93.0%）。在所测定序列中以来自贵州省2005年的GZ09与人用疫苗毒株CTN和动物用疫苗株Flury株G同源性最高,而以2010年的GZ30与人用疫苗毒株CTN和动物用疫苗株Flury株G基因同源性最低。系统进化树分析显示,本次所测定的序列和9株疫苗株与狂犬病病毒基因1～7型中的基因1型代表毒株聚类在同一分支,与疫苗毒株中的CTN亲缘进化关系最近,而与其他疫苗株相对较远,所测定序列中以2005年的GZ09与CTN疫苗株同源性最近,而其他序列与CTN毒株的亲缘进化关系相对较远。结论本研究从狂犬病病毒G基因水平证明贵州省狂犬病病毒流行毒株与常用的疫苗株同属狂犬病病毒基因1型,与人用疫苗株中的CTN毒株及兽用疫苗株中的Flury株差异最小,且随着时间的推移贵州省狂犬病病毒流行毒株与疫苗毒株G基因的差异越来越大,该研究结果将为狂犬病疫苗研制及有效防控措施的制定提供科学依据。