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青岛市2014—2016年聚集性病例中诺如病毒的分子流行病学特征

         

摘要

目的了解青岛市2014—2016年聚集性腹泻病例中诺如病毒(norovirus, NoV)的分子流行病学特征。方法收集2014年1月至2016年12月间青岛市聚集性NoV腹泻病例粪便标本,real-time RT-PCR进行NoV检测,应用RT-PCR扩增NoV ORF1和ORF2部分基因片段,并进行序列测定和系统进化分析。结果共报告23起聚集性NoV疫情,粪便标本260份,NoV阳性128份,其中GⅠ阳性6份,GⅡ阳性122份。分成6个基因型,分别是GⅡ.P17-GⅡ.17、GⅡ.P12-GⅡ.3、GⅡ.P7-GⅡ.6、GⅡ.P2-GⅡ.2、GⅠ.Pb-GⅠ.6和GⅡ.Pg-GⅡ.12。既有单一感染,也有混合感染。GⅡ.17单一感染11起,GⅡ.3单一感染4起,GⅡ.17和GⅡ.3混合感染3起,GⅡ.17和GⅡ.6混合感染2起,GⅠ.6单一感染1起,GⅡ.17和GⅡ.2混合感染1起,GⅡ.17和GⅡ.12混合感染1起。结论 NoV是聚集性病毒性腹泻的重要病原体。青岛市2014—2016年聚集性NoV具有基因多样性。新变异株GⅡ.P17-GⅡ.17是2014—2016年青岛市聚集性NoV的主要流行株。

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