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应用MALDI-TOF MS快速鉴定bla_(KPC-2)基因型肺炎克雷伯菌

             

摘要

目的探讨基质辅助激光解析/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对携带bla_(KPC-2)基因型肺炎克雷伯菌的快速鉴定能力。方法收集2018年9月—2020年11月蚌埠医学院第一附属医院临床住院患者分离的肺炎克雷伯菌,采用纸片扩散法进行药敏试验。应用聚合酶链反应(PCR)方法筛选携带bla_(KPC-2)基因型肺炎克雷伯菌。MALDI-TOF MS鉴定菌株并收集携带bla_(KPC-2)基因型和碳青霉烯类敏感肺炎克雷伯菌(CSKP)的质谱图,各自选取其中70株菌株图谱,建立携带bla_(KPC-2)基因型和CSKP的超级图库(Super-Spectra)。采用超级图库鉴定除建库以外的肺炎克雷伯菌,根据耐药表型和PCR结果,判断鉴定结果是否准确。结果共收集295株肺炎克雷伯菌,经耐药表型筛选耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)143株和CSKP 152株。CRKP中鉴定出140株携带碳青霉烯酶基因(134株检出bla_(KPC-2)基因,3株检出blaKPC-18基因,2株检出blaNDM-1基因,1株检出blaIMP基因),3株不携带碳青霉烯酶基因;其中2株同时检出bla_(KPC-2)基因和blaNDM-1基因。根据建库要求,建立携带bla_(KPC-2)基因型和CSKP的超级图库(Super-Spectra);设置error值<0.5,二者重合率达80%;对比图发现,4154.4、8310.7、10880.8、3579、10079.3 m/z五个峰可作为区分携带bla_(KPC-2)基因肺炎克雷伯菌和CSKP的特征峰。选取除建库以外的155株肺炎克雷伯菌进行验证,准确率为92.90%(144/155);其中携带bla_(KPC-2)基因肺炎克雷伯菌准确率为94.52%(69/73),CSKP准确率为91.46%(75/82)。结论通过MALDI-TOF MS建立Super-Spectra,可快速预测bla_(KPC-2)基因型肺炎克雷伯菌,为临床CRKP感染的诊疗及医院感染防控提供可靠的实验室依据。

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