多组学筛选及验证lncRNA CCAT1通过调节miR-148b-3p和FGF9促进结直肠癌发生及发展机制研究

摘要

目的 通过生物信息学及分子生物学探讨lncRNA CCAT1对结直肠癌(colorectal cancer,CRC)细胞增殖的影响,并进一步探讨其机制.方法 应用R软件和Bioconductor软件包对9例CRC样本和9例正常样本进行差异表达基因(DEGs)分析,筛选差异表达lncRNA和mRNA.进一步选择30例CRC组织及匹配的癌旁组织(2016年1月至2019年12月从新疆医科大学第一附属医院CRC外科手术中获得的标本),然后通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测CRC组织及CRC细胞中CCAT1、miR-148b-3p、FGF9的表达,采用蛋白免疫印迹试验(Western blotting)检测CRC细胞中FGF9的表达情况.细胞转染后,用CCK-8法检测细胞活力,流式细胞术检测细胞周期和凋亡.采用Transwell迁移实验检测各处理组细胞迁移情况.通过双荧光素酶报告基因检测验证CCAT1与miR-148b-3p、miR-148b-3p与FGF9的靶向关系.结果 与癌旁组织及人正常结直肠上皮细胞相比,CCAT1在CRC组织和细胞系中高表达且差异有统计学意义(P<0.05).进一步分析发现,高表达CCAT1的CRC患者与低表达CCAT1的患者相比,肿瘤较大,TNM分期较晚,总生存率较低.生物学功能测定结果表明,CCAT1具有促进细胞增殖的作用.我们还发现miR-148b-3p可以作为CCAT1在CRC细胞中的作用靶点,miR-148b-3p的过表达可以有效抑制由CCAT1敲低诱导的CRC进程.此外,我们发现FGF9作为miR-148b-3p的靶点在CRC中发挥致癌作用.结论 CCAT1可通过调控miR-148b-3p及其靶蛋白FGF9促进CRC细胞增殖,这将为CRC的预防及治疗提供一个有效的治疗靶点及理论依据.