基于线粒体D-loop区序列的中华鳖不同群体遗传差异分析

摘要

2018年5-11月期间,在太湖流域苏州太仓和武进及洪泽湖流域宿迁泗洪地区采集69尾野生中华鳖Trionyx sinensis三个群体(太湖花鳖群体、太湖鳖群体和洪泽湖鳖群体),测定分析腿部肌肉的线粒体D-loop区序列.结果 显示,在获得的约515 bp碱基序列中,片段的同源性达到95.76％;存在变异的核苷酸位点共12个,总变异率为2.43％;太湖花鳖群体、太湖鳖群体和洪泽湖鳖群体的核苷酸多样性(π)分别为0.0031、0.0014和0.0046,群内序列同源性分别为99.23％、99.14％和98.95％;三个群体间遗传距离为0.0479,太湖鳖群体和洪泽湖鳖群体遗传距离最小(0.0165),太湖花鳖群体和洪泽湖鳖群体遗传距离最大(0.0499).用MEGA5.1软件构建的分子系统树表明,三个群体明显分为两支,太湖花鳖群体单独聚类,太湖鳖群体和洪泽湖鳖群体混合聚类且有一定的分化趋异.太湖花鳖群体与太湖鳖群体和洪泽湖鳖群体之间遗传差异已经达到亚种间水平,三个群体的遗传多样性均处于较低水平,需予以重视,保护其种质资源.