胃癌自噬相关长链非编码RNA预后模型的建立与分析

摘要

背景与目的胃癌是常见的胃肠道肿瘤之一,其预后较差。大量研究表明自噬失调影响胃癌的发生与发展,本研究构建了胃癌自噬相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)预后风险模型,并分析了胃癌自噬相关lncRNA潜在的临床预后价值。方法从癌症基因图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载443例胃癌患者的年龄、性别、生存时间、生存状态、肿瘤分期以及分级等临床相关资料,及其中375例胃癌患者的肿瘤组织和32例癌旁组织对照样本的转录组数据(mRNA和lncRNA)。从人类自噬数据库(Human Autophagy Database,HADb)下载自噬相关基因,采用Pearson相关性分析筛选出胃癌中与自噬基因相关的LncRNA。通过Kaplan-Meier法、单因素和多因素Cox回归分析筛选出具有独立临床预后价值的胃癌自噬相关LncRNA,并构建预后模型。然后,通过多因素Cox回归系数计算风险评分,将胃癌患者分为低风险组和高风险组,分析风险评分与胃癌患者的临床特征和总生存率的相关性。结果共筛选和鉴定出26个具有临床预后价值的胃癌自噬相关LncRNA(P<0.05)。计算26个LncRNA的风险评分,构建了4个自噬相关LncRNA(LINC01980、AL355574.1、AC087286.2、AP000695.2)的胃癌预后风险模型。低风险组患者的总生存率显著高于高风险组(P<0.05)。4个自噬相关LncRNA的预后模型评分与患者的年龄、病理学分期及N分期相关(P<0.05)。结论胃癌自噬相关lncRNA预后模型对胃癌的预后具有一定的预测价值。