rDNA测序在酵母菌和丝状真菌鉴定中的临床应用评价

摘要

目的 评价核糖体RNA(rDNA)测序,在临床酵母菌和丝状真菌鉴定中的应用价值.方法 收集61株真菌(包括5株标准菌株,9株室间质评酵母菌,24株临床酵母菌,23株临床丝状真菌),通过设计通用引物ITS和26S D1/D2,对61株真菌进行PCR扩增并对扩增产物进行双向测序,将获得的所有序列在Seqman中打开,选取ITS和26S D1/D2正反向序列无重叠峰片段,进行BLAST核酸序列比对.结合Mycobank真菌分类信息以获得菌株鉴定结果.结果 61株真菌全部扩增成功,剔除杂峰后,所有菌株联合ITS和26S D1/D2测序鉴定,100％菌种能鉴定到属或群,97.0％(32/33)的酵母菌与73.9％(17/23)的丝状真菌准确鉴定到种.结论 经优化后的核糖体RNA(rDNA)测序,能准确快速的鉴定临床常见真菌与疑难菌.