基于BLUP和GBLUP方法估计北京油鸡胴体和肉质性状遗传参数的差异

摘要

旨在比较不同方法对遗传参数估计的差异,为未来北京油鸡胴体和肉质性状选育方法的制定提供参考依据。本研究利用传统最佳线性无偏预测(best linear unbiased prediction,BLUP)和基因组最佳线性无偏预测(genomic best linear unbiased prediction,GBLUP)两种方法对北京油鸡的胴体和肉质等性状进行了遗传参数估计。从系谱较为完整的北京油鸡群体中,选择100日龄体重相近的公鸡615只,测定其100日龄体重(BW)、屠宰率(EP)、胸肌率(BMP)、腿肌率(LMP)、腹脂率(AFP)、嫩度(T,以剪切力值表示)和肌内脂肪(IMF)等性状,并用SNP芯片(Illumina,60K)进行个体基因分型。结果表明,除IMF和剪切力(SF)遗传力基于两种方法的估值存在较大差异外,其余性状利用两种方法得到的遗传力估值差异较小;除嫩度外,GBLUP方法估计的遗传力均低于BLUP方法。所有胴体相关性状中,除屠宰率遗传力为低遗传力外,其余性状均属于中等遗传力性状。嫩度呈现低遗传力,而IMF基于BLUP法和GBLUP法的估计遗传力分别为中等(h^2=0.256)和低遗传力(h^2=0.107)。基于BLUP方法,IMF与BW、BMP和SF 3个性状间均呈高度遗传负相关(-0.572、-0.420、-0.682),与EP的遗传相关为中度负相关(-0.234),与AFP的遗传相关为中度正相关(0.420);基于GBLUP方法,IMF与BW、BMP和SF 3个性状间均呈高度遗传负相关(-0.808、-0.725、-0.784),与EP的遗传相关为高度负相关(-0.626),与AFP的遗传相关为低度正相关(0.097)。综上,对于某些性状,基于传统的BLUP方法与新的GBLUP方法得到的遗传力与遗传相关估值存在较大差异,实际育种工作中,为提高育种效率,需要综合考虑。