母猪杀婴行为的全基因组关联分析

摘要

本研究测定了288头来自白色杜洛克×二花脸F2群体的母猪杀婴行为表型,旨在定位出影响母猪杀婴行为的QTL.基于整个家系及已经扫描个体的60K SNP芯片信息推测出本试验288头个体60K的基因型.随后,我们利用R语言GenABEL软件包的广义混合线性模型对母猪杀婴行为表型进行全基因组关联分析,定位影响母猪杀婴行为的显著关联SNP位点.结果,在SSC2和SSC8上共发现50个与母猪杀婴显著关联的SNPs位点,其中有21个SNPs位于SSC8:35.05～47.54 Mb区域达到基因组显著水平,在SSC2上只有1个SNP位点达到染色体显著水平.通过搜寻显著相关SNP所在区域内的注释基因,发现了12个可能影响母猪杀婴行为的重要位置候选基因.该研究为进一步鉴别影响母猪杀婴行为的主效基因和因果突变位点提供了研究基础.