天津滨海新区泡桐丛枝病植原体16S rDNA基因序列分析

摘要

利用分子生物学技术对天津滨海新区泡桐丛枝病病原进行分类鉴定.采用植原体16S rDNA通用引物R 16mF2/R16mR1对患病植株总DNA进行PCR扩增,得到约1.4 kb特异性片段.克隆测序、Blast比对和iPhyClassifier分析结果表明,天津滨海新区泡桐丛枝植原体16S rDNA基因片段长1 432 bp,与国内泡桐丛枝植原体PY株系相似性最高,达99.86％,归属于16SrI组(aster yellows group,翠菊黄化组)D亚组.系统树构建与分析显示,泡桐丛枝病天津滨海株PaWB-TJBH与16SrI其他亚组亲缘关系较近,同在16SrI组进化枝上,与16Sr I-D组亲缘关系最近;16S rDNA序列RFLP电子酶切图谱表明,PaWB-TJBH属于16SrI-D组一个成员,与同源性比较和系统进化分析结果一致.