加权基因共表达网络分析筛胃癌相关分子

摘要

目的 运用加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选出与胃癌发生、预后相关的分子,为胃癌的治疗和预后判断提供参考依据.方法 从TCGA数据库中下载胃癌患者基因表达谱和临床数据,检索时间为建库至2020年11月14日.采用WGCNA方法对胃癌患者进行基因表达分析;筛选出核心靶基因并分析其功能,利用ONCOMINE和GEO数据库进行验证.结果 共纳入359例胃癌患者. BLUE模块与胃癌发生、预后相关,CDC5L为核心靶基因,CDC5L与胃癌发生、预后相关. ONCOMINE数据库验证结果 显示,癌组织中CDC5L表达量高于癌旁组织(P＜0.01);GEO数据库验证结果 显示,低表达CDC5L患者预后更好.结论 CDC5L基因与胃癌发生和患者生存相关,可为胃癌发生、转移和治疗的研究提供参考依据.