基于全基因组重测序构建西瓜高密度遗传图谱和果实相关性状的基因定位

摘要

cqvip:目的与意义:遗传图谱是进行重要农艺性状QTL/基因定位、图位克隆、分子标记辅助育种等工作的重要工具.长期的人工选择使得栽培种西瓜的遗传基础进一步狭窄,使得高效可获得的分子标记成为限制西瓜高密度遗传图谱构建的重要因素.随着高通量测序技术的发展和西瓜参考基因组草图的组装完成,通过测序获得大量分子标记以构建高密遗传图谱成为可能.通过全基因重测序构建高密度遗传图谱,可以更快更准确的检测重组断点,开发大量适于遗传图谱构建的分子标记.最近几年,陆续有多张西瓜遗传图谱发表.但这些图谱大都基于简化基因组测序,遗传图谱的饱和度相对不足;作图群体多为临时性分离群体,不能进行重复试验,影响后续基因定位工作的准确性.笔者构建了重组自交系作为永久性作图群体,通过对其进行全基因组重测序构建了一张西瓜高密度遗传图谱,并对果皮颜色、种皮颜色和果实苦味3个性状进行了初定位,以期用于西瓜分子遗传育种等工作.