通过线粒体DNA D-环序列多态性决定亚洲和欧洲猪品种间的系统发育关系

摘要

线粒体DNA-D环1036bp序列可以用来评估亚洲和欧洲猪的系统发育关系.以最大相似距离为基础构建了一种运用算术平均值进化树的非平衡配对方法.计算遗传距离所用序列来源于3种南韩猪(Cheju)、11种中国猪、1种澳大利亚野猪(westran)、2种欧洲猪(波克夏和welsh),以及已经发表的序列:4种日本猪(包括2种野猪)、1种小型猪(yucatan)、5种欧洲猪(包括长白、杜洛克、兰德瑞斯、swedish和野猪、2种梅山猪.同时测定了哥伦比亚颈圈野猪(tayassu tajacu)的序列并作为一个外围品种.应用最简化的搜寻方法确定bootstrap抽样.亚洲猪聚类在一起(引导程序支持33%),与欧洲猪截然分开(引导程序支持93%).起源于南大洋洲kangaroo岛的野猪westran应归类于亚洲猪种,证明它们的线粒体与亚洲猪种同源.波克夏和长白归类于亚洲猪种,表明亚洲猪种参与了它们的选育过程.研究结果表明,中国、韩国、日本猪的地方品种只是最近才分开,它们明显的不同于欧洲猪种.欧洲猪由亚洲类和非亚洲类猪(依据线粒体分类)组成,其中一些品种是由母系亲缘关系相近或同一祖先演化而来.