猪输卵管特异性糖蛋白结构与功能的生物信息学分析

摘要

利用Lasergene、Protscale、SOPMA、Mega、ScanProsite等生物信息学软件对猪输卵管特异性糖蛋白(oviduct-specif-ic glycoprotein,OGP)进行物理性质、结构及系统进化分析.结果表明,猪OGP cDNA包含1个1581 bp的开放阅读框,编码527个氨基酸,有信号肽,属于分泌蛋白,无明显疏水区;猪OGP蛋白二级结构主要是α-螺旋和不规则卷曲.系统进化分析结果表明,猪OGP蛋白与绵羊OGP亲缘关系最近,与牛OGP的亲缘关系较远.提示,OGP蛋白属于糖苷水解酶18 (glycosyl hydrdase 18 family,GH18)家族,牛OGP的GH18结构与猪的差别较大.