一株猪Ⅱ型圆环病毒的分离鉴定及基因组序列分析

摘要

2011年11月,北京某猪场暴发以全身斑块状出血、腹泻及腹股沟淋巴结明显肿大为主要特征的传染性疾病.采集发病猪淋巴结、肾脏和脾脏组织,研磨成组织混悬液,经0.2μm滤膜过滤后接种PK15细胞,然后用D-氨基葡萄糖处理,连续盲传3代后收取细胞病毒液并提取DNA,经PCR检测、免疫荧光鉴定、全基因组测定及用DNAStar软件对序列进行拼接和分析,结果表明,该分离株为猪Ⅱ型圆环病毒(porcine circovirus type 2,PCV2),命名为BJ20111113株,其全基因组长度为1767 bp,与国内外毒株核苷酸序列同源性为94.5％～99.8％,其中与HM038017(BDH株)亲缘关系最近,同源性高达99.8％；与EU148504亲缘关系较远,同源性为94.5％.进化分析结果表明,本研究2011年分离的BJ20111113株属于基因型PCV2b.