鸡传染性支气管炎病毒广西株M基因的克隆与序列分析

摘要

参照GenBank中鸡传染性支气管炎病毒(IBV)的核苷酸序列设计1对引物,利用PCR扩增IBV广西株的M基因片段,将其克隆到pMD18-T载体中.序列分析结果表明,M基因全长为678 bp,编码225个氨基酸,近N端含有2个潜在的N-糖基化位点,3个跨膜区位于23-98肽段区,亲水区较疏水区更易变异.IBV广西株与国内外IBV参考毒株相比,核苷酸序列同源性为83.6％～92.5％,氨基酸序列同源性为82.7％～95.1％.系统进化分析结果显示IBV广西株与SAIB20和LX4两参考株位于同一个分支上,它们的亲缘关系较近,而与其他参考株属于不同的分支,亲缘关系较远.结果表明IBV广西株是1株新的IBV变异株.