DNA序列编码及相似度计算

张宝华; 王海水; 许禄

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DNA序列编码及相似度计算

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将DNA的一级序列如β-球蛋白基因的第一个外显子(Exon)转化为分子"结构图", 然后由所得"结构图"提取图的不变量, 如分子连接性指数.以图的不变量作为自变量, 再由相似度计算公式或距离公式进行相似度计算, 其相似度的大小显示不同物种间亲缘关系的远近程度.运用这种方法对人、猴及鼠等8个物种的β-球蛋白基因的第一个外显子的相似度进行计算, 所得结果与生物学中的进化树符合得较好.

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来源
《高等学校化学学报》 |2006年第12期|2277-2280|共4页
作者
张宝华; 王海水; 许禄;
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作者单位

中国科学院长春应用化学研究所,长春,130022;

中国科学院长春应用化学研究所,长春,130022;

中国科学院长春应用化学研究所,长春,130022;

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正文语种 chi
中图分类分析作业方法与技术;基因的表达;
关键词
DNA序列; 外显子; 分子连接性指数; 相似度比较; 进化树;

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