白色念珠菌N-肉豆蔻酰基转移酶中药物结合位点的MCSS分析

摘要

采用多拷贝同时搜寻方法(MCSS)分析得到了CaNMT活性位点的疏水区域、氢键结合位点和负电性区域.MCSS计算结果显示,CaNMT活性位点有两个疏水性比较强的区域: 一个由Tyr107,Tyr109,Val108,Phe117,Phe123,Ala127,Phe176和Leu337等残基组成;另一个由Phe115,Phe240和Phe339组成.CaNMT活性位点发现有两个氢键作用区域,其中Tyr119,His227,Asn392和Leu451是与已有抑制剂的氢键结合位点,Tyr107,Asn175,Thr211和Asp412是新发现的氢键结合位点,而且在NMT家族中高度稳定,它们对设计新结构类型的CaNMT抑制剂具有重要作用.Leu451是负电性兼氢键作用位点,是抑制剂设计时所必需考虑的位点.