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mRNA可变剪接问题的并行化研究

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摘要

对mRNA可变剪接问题进行了并行化分析和研究,解决了原AltSplice程序中Nbest参数选取欠合理的问题,结合实验实现了基于MPI平台的并行AltSplice版本MPI_AltSplice,并在5万亿次的联想深腾6800高性能计算机上获得了较好的运行性能.

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来源
《计算机应用研究》|2008年第3期|705-708|共4页
作者
牛北方; 郎显宇; 陆忠华; 迟学斌;
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作者单位

中国科学院,计算机网络信息中心,超级计算中心,北京,100080;

中国科学院,研究生院,北京,100049;

中国科学院,计算机网络信息中心,超级计算中心,北京,100080;

中国科学院,研究生院,北京,100049;

中国科学院,计算机网络信息中心,超级计算中心,北京,100080;

中国科学院,计算机网络信息中心,超级计算中心,北京,100080;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类 TP311.52;
关键词
可变剪接; AltSplice; 并行化; 表达序列标签(EST)序列库; 消息传送接口;
入库时间 2022-09-01 14:25:30

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