基于离散增量的免疫分类器在模式生物基因中应用

摘要

首先把线虫、酵母和拟南芥三种模式生物基因组中的内含子、外显子和基因间序列归为三类, 滑动统计这些序列中64种三核苷的重复出现次数作为离散源的状态参数,这样就得到了这些序列的64维特征值,并将这些数据分成训练样本集和测试样本集.根据免疫进化网络理论,用离散增量作为抗体-抗原间的亲和度函数,把训练集看成抗原,不断刺激免疫网络向识别抗原的方向进化,构造了一个基于离散增量的免疫分类器.通过测试表明,该分类器性能优良,分类预测准确率达到了85%以上.