一个基于软件设计模式的生物信息存储模式

摘要

为了消除各生物信息学数据库之间的模式异构问题,根据生物信息的存储现状,提出了一种存储模式.该模式从物种、类别、基本信息、功能和测序方法五个方面对数据中的信息进行抽象.运用了软件设计模式的思想,通过"派生""组装"等面向对象的方法生成与模式对应的XML schema文件.抽象出的存储模式不但能使数据之间的关系更加紧密,而且可以形成交叉索引的完整生物信息体系.