成年与未成年圈养林麝粪便菌群多样性的比较

摘要

本研究旨在解析林麝未成年组(n=10)和成年组(n=10)之间的菌群差异.收集林麝新鲜粪便,提取总DNA,利用带标签的通用引物扩增16S rRNA V3-V4区,使用Illumina Miseq 300PE测序平台对扩增产物进行Miseq双端测序,通过计算ACE和Shannon等多样性指数,以及微生物组成成分和距离聚类分析,揭示组成结构与差异.α多样性分析表明成年组微生物的多样性丰富度略高于未成年组,但不存在显著差异性(P＞0.05).未成年组和成年组均是厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和变形菌门(Proteobacteria)所占的比例较高.成年组Proteobacteria比例明显高,而Firmicutes比例较低.LEfSe分析表明有12个显著差异的细菌分类.两组在Firmicutes门存在显著差异的细菌较少,而在Proteobacteria上存在显著差异的细菌较多.本研究证明在不同年龄阶段,微生物的丰富度和多样性不存在显著差异,细菌的组成成分也相同.但是在组成比例上存在差异性,间接反映了不同年龄阶段营养吸收的不同需求.