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电喷雾质谱法研究天然产物小分子识别人类端粒G-四链体及复合物的热稳定性

     

摘要

利用电喷雾质谱(ESI-MS)研究了12种天然产物小分子与人类端粒G-四链体结构的非共价相互作用和识别功能,比较了不同小分子与人类端粒G-四链体的结合强弱,发现了一种新的识别小分子--防己诺林碱对人类端粒G-四链体有很好的结合.通过质谱升温实验比较了小分子结合对G-四链体热稳定性的影响,防己诺林碱的结合使G-四链体的离子的解离温度(T_(1/2))上升到200℃.利用分子模拟对G-四链体DNA与小分子结合的模式以及稳定性进行了探讨,给出了防己诺林碱可能的结合位点和结合模式,Autodock计算出来的结合能约为-31.5 kJ·mol~(-1).同原来的平面型分子不同,防己诺林碱是一类新型结构的分子,为设计合成新型G-四链体识别分子提供了新的结构模型.

著录项

  • 来源
    《物理化学学报》|2010年第4期|1082-1086|共5页
  • 作者单位

    北京大学化学与分子工程学院化学生物学系,北京分子科学国家实验室,生物有机与分子工程教育部重点实验室,北京,100871;

    北京大学化学与分子工程学院化学生物学系,北京分子科学国家实验室,生物有机与分子工程教育部重点实验室,北京,100871;

    北京大学化学与分子工程学院化学生物学系,北京分子科学国家实验室,生物有机与分子工程教育部重点实验室,北京,100871;

    北京大学化学与分子工程学院,北京,100871;

    北京大学世佳研究中心,北京,100084;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 结构化学;
  • 关键词

    分子模拟; 端粒; G-四链体DNA; 天然产物小分子; 电喷雾质谱;

  • 入库时间 2023-07-25 11:13:57

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