罗伊氏乳杆菌肠道分离株的遗传多样性研究

摘要

动物体内定殖着丰富且多样的细菌,其对宿主的健康发挥着举足轻重的作用.罗伊氏乳杆菌(Lactobacillus reuteri)是存在于动物肠道中的益生菌,是研究肠道菌群与宿主进化关系的模式菌种.[目的]以下载自NCBI的分离自猪、家禽类、人类、啮齿类动物的116株L.reuteri和分离自内蒙古锡林郭勒牛、羊和马肠道中的16株L.reuteri为研究对象,解析L.reuteri不同分离株的遗传多样性和宿主特异性,为L.reuteri的开发利用提供理论依据.[方法]利用MLST技术,以ddl、pkt、leuS、gyrB、dltA、rpoA、recA共7个看家基因为研究靶点,对L.reuteri分离株遗传多样性进行研究,推演分离株与宿主生境的进化关系.[结果]132株L.reuteri共划分为63个序列型,6个克隆复合体.等位基因序列重组分析发现,在L.reuteri的进化中发生了个别的重组事件,eBURST、MSTree分析表明不同分离源的L.reuteri分离株经历了不同的进化过程,系统发育分析表明132株L.reuteri来自5个Clusters且与分离源表现出较强的相关性.[结论]本研究利用MLST技术完成了132株L.reuteri肠道分离株的遗传多样性分析,利用MSTree、系统发育等群体结构分析,发现不同分离源菌株有着高度的宿主特异性,表明L.reuteri为适应不同生存环境经历了不同的进化过程.